南京农业大学身上的显赫标签已然不少，教育部直属211大学，34所“985优势学科创新平台”高校之一，但是说南京农业大学被低估，是因为南京农业大学拥有着985高校的实力，却因为农林院校的缘故被歧视。

南农拥有国家和部级科研平台38个，省级科研平台30个，国家和省部级科研平台达到惊人的68个，而且南京农业大学拥有一级国家重点学科4个，另外还有4个二级国重（含培育），其拥有的国家重点学科数量可以排到全国第26名，而南农的农业科学、植物与动物学、环境生态学、生物与生物化学等4个学科领域进入ESI学科排名全球前1%，在教育部第三轮全国高校学科评估中，南京农业大学共有12个学科参评，6个学科排在前5位，10个学科排在前10位，其中农业资源与环境排在第1位。作为最早56所拥有研究生院的高校之一，综合实力即使和同领域的985高校中国农业大学和西北农林科技大学相比，也并不逊色。