报考条件不同
同等学力的报考条件一般满足大专学历就可免试入学，本科毕业有学士学位满3年的学员还可参加申硕考试。
专业硕士报考是需学员本科毕业满3年以上工作经验；高职高专满5年以上工作经验的人员；已获硕士、博士学位满2年工作经验的人员。
入学方式不同
同等学力入学门槛低，学员符合入学条件就可免试入学，属于先学后考，这样学员就不会有太大的压力。
而专业硕士是先参加入学考试，考试通过以后才可进校学习专业课程。
考试时间不同
同等学力学员的考试报名时间为每年的3月份，报名资料经院校审核通过后，5月份参加申硕考试，考试难度比较低。
专业硕士需要学员在9月份预报名，10月份正式报名，考试时间于同年的12月底或次年1月初，学员有2个月的备考时间。
获得证书不同
同等学力的学员最终可获在职研究生结业证书与硕士学位证书，是单证。
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